84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0127 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  314  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  66.9 
 
 
161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  60 
 
 
157 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  65.85 
 
 
157 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  57.66 
 
 
158 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  41.98 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  39.06 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  42.15 
 
 
135 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  40.94 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  42.36 
 
 
176 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  40.16 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  40.16 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  42.96 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  35.61 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  36.15 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  34.85 
 
 
138 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  39.16 
 
 
177 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  35.34 
 
 
138 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  34.09 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  31.17 
 
 
162 aa  87.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  36 
 
 
138 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  36 
 
 
138 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  34.67 
 
 
166 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  37.42 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  38.46 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  38.19 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  36.3 
 
 
177 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  34.1 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  39.46 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  39.46 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  40.14 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  32.35 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  36.62 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  36.52 
 
 
187 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  35.19 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  36.69 
 
 
175 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  34.04 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  36.49 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  35.76 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  35.71 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  32.64 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  33.33 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  36.99 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  31.25 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  36.24 
 
 
178 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  28.89 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  31.48 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  32.28 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  26.92 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  24.65 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  33.64 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  28.17 
 
 
174 aa  60.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  27.07 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  30.66 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  23.36 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  28.89 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  27.59 
 
 
158 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  28.78 
 
 
145 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  27.97 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  30.17 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  26.67 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  31.09 
 
 
143 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  29.6 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  25.71 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  24.64 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  27.07 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  24.64 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  23.91 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  24.64 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  24.64 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  30.87 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  24.64 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  24.64 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  33.93 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  24.64 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  26.83 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  24.82 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  24.82 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  24.82 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  30.93 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>