49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5012 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  83.02 
 
 		 158 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  62.99 
 
 		 155 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  62.25 
 
 		 155 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  46.75 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  46.75 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  46.75 
 
 		 162 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  28.68 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  26.87 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  30.61 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  25.9 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  25.37 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  25.37 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  26.15 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  26.15 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  26.15 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  26.15 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  27.97 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  25.18 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  24.46 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  25.38 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  27.07 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  29.63 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  26.57 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  25 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  28.16 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  24.44 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  28.16 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  28.16 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  29.36 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  28.86 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  23.68 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  24.65 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  24.07 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  32.22 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  30.28 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  29.91 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.68 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  26.72 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  27.68 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  25.47 
 
 		 162 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  27.68 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  27.68 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  27.36 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  24.07 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  25.89 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  27.43 
 
 		 173 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  25 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>