25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0125 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  62.99 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  59.21 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  60.39 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  32.33 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  28.89 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  26.87 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  31.11 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  26 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  29.13 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  24.76 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  24.76 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  31.68 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  29.79 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  29.36 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  20.59 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  26.36 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  22.22 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  22.73 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1310  cyclase/dehydrase  34.88 
 
 		 192 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48096  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  22.86 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>