80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4813 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  48.97 
 
 
144 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  45 
 
 
147 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  41.67 
 
 
144 aa  126  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  45.93 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  45.93 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  45.93 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  45.93 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  45.93 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  45.93 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  45.93 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  45.19 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  40.56 
 
 
143 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  38.85 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  31.91 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  28.67 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  28.67 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  29.37 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  29.37 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  34.03 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  29.37 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  28.67 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  28.67 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  28.67 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  28.67 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  30.07 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  30.14 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  32.31 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  33.86 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  30.61 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  36.52 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1923  hypothetical protein  35.66 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  31.79 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  33.59 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  35.09 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  28.67 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  32.79 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  31.94 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  30.14 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  30.2 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  30.83 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  29.73 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  32.12 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  29.73 
 
 
176 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  26.06 
 
 
187 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  30.07 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  33.33 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  35.14 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  32.28 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  30.3 
 
 
176 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  28.28 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  28.28 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  28.24 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  28.78 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  27.59 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  31.37 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  26.35 
 
 
175 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  26.57 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  26.32 
 
 
174 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  27.01 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  23.18 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  28.57 
 
 
184 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  26.92 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  25 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  25 
 
 
176 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  29.09 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  24.32 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  24.32 
 
 
176 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  26.98 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  26.71 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  22.56 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  27.41 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  26.96 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  31.82 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  28.07 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>