75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4508 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  98.3 
 
 		 176 aa  349  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  92.36 
 
 		 177 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  69.44 
 
 		 184 aa  248  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  63.79 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  56.77 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  54.09 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  47.31 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  45.09 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  44.12 
 
 		 167 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  47.13 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  47.17 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  47.56 
 
 		 179 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  47.44 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  42.53 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  44.19 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  44.1 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  44.65 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  45.45 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  44.03 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  44.94 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  41.52 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  42.31 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  38.82 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  41.86 
 
 		 195 aa  110  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  40.12 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  39.35 
 
 		 183 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  34.64 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  39.61 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  37.95 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  42.73 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  34.75 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  36.17 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  33.14 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  37.59 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  41.58 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  32.93 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  32.93 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  32.18 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  31.2 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  29.93 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  31.03 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  33.63 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  30.07 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  30.77 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  28.17 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  28.17 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  29.92 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  30.69 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  32.21 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  33.65 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  28.04 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  25.45 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  27.46 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  33.04 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  28.04 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  27.1 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  29.2 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  27.52 
 
 		 135 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.38 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0772  hypothetical protein  22.79 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000821647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>