82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3357 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  326  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  48.28 
 
 
161 aa  146  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  41.98 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  48.84 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  45.07 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  44.37 
 
 
157 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  39.22 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  37.42 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  37.18 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  33.77 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  36.15 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  37.01 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  30.63 
 
 
162 aa  79  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  36.91 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  33.54 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  34.78 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  34.01 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  33.33 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  33.33 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  36.73 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  36.76 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  36.03 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  36.03 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  33.54 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  29.65 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  33.57 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  32.73 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  30 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  31.72 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  29.71 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  31.85 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  30.64 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  34.48 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  31.58 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  30.92 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  30.52 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  32.28 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  35.51 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  29.61 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  24.81 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  30.61 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  27.27 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  29.2 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  32.31 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  31.58 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.8 
 
 
176 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  26.14 
 
 
176 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  26.14 
 
 
176 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  26.85 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  32.17 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  29.32 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  31.03 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  29.2 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  27.07 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  27.69 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4273  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  27.82 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  23.94 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  32.41 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0900  cyclase/dehydrase  30.39 
 
 
150 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0349496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  26.72 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  32.63 
 
 
195 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0911  cyclase/dehydrase  30.39 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0894  cyclase/dehydrase  30.39 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>