70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4385 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  67.55 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  74.68 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  70.62 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  70.51 
 
 		 183 aa  225  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  65.22 
 
 		 176 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  65.62 
 
 		 176 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  65.62 
 
 		 176 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  59.52 
 
 		 175 aa  194  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  50.29 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  53.85 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  54.78 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  47.8 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  48.47 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  49.69 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  47.44 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  45.98 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  54.97 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  45.51 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  47.47 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  44.2 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  43.31 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  44.59 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  43.95 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  40.88 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  37.22 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  42.33 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  34.09 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  43.43 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  38.3 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  36.63 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  36.17 
 
 		 138 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  36.17 
 
 		 138 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  38.67 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  37.84 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  36.17 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  39.73 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  35.46 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  35.46 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  36.52 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  34.97 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  33.79 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  36.05 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  34.04 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  36.45 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  34.01 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  32.65 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  32.65 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  31.58 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  26.06 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  30.14 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  28.08 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  22.97 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  27.08 
 
 		 140 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  48.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  25.36 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  29.14 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  27.63 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  30.63 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  26 
 
 		 142 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  30.19 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  27.59 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  29.52 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>