41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2108 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  61.44 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  60.39 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  60 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  51.33 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  51.33 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  51.33 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  32.33 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  28.68 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  29.9 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  30.39 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  23.81 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  23.81 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  24.41 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  24.41 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  22.83 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  24.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  24.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  24.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  24.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  23.85 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  23.85 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  23.85 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  23.62 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  24.19 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  25.37 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  25.56 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  27.52 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  30.95 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  32.11 
 
 		 135 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  24.58 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  23.97 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.29 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  26.92 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  25.69 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  25.21 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  23.97 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  21.82 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  27.63 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  27.63 
 
 		 176 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>