62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1819 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  46.89 
 
 
184 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  48.47 
 
 
174 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  45.68 
 
 
177 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  45.22 
 
 
176 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  42.21 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  42.21 
 
 
177 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  41.56 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  43.43 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  45.22 
 
 
176 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  41.92 
 
 
179 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  43.23 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  38.01 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  41.29 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  37.87 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  39.13 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  39.62 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  40.13 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  37.34 
 
 
176 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  37.5 
 
 
178 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  36.71 
 
 
176 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  36.08 
 
 
176 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  37.74 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  36.13 
 
 
177 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  40.13 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  33.33 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  35.47 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  34.12 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  36.09 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  35.33 
 
 
168 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  33.73 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  35.16 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  38.18 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  31.11 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  30.14 
 
 
161 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  34.09 
 
 
157 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  32.45 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  28.03 
 
 
157 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  37.25 
 
 
138 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  37.25 
 
 
138 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  32.12 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  30.9 
 
 
162 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  32.69 
 
 
136 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  29.41 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  28.1 
 
 
138 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  28.1 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  28.1 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  28.1 
 
 
138 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  30.14 
 
 
155 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  28.1 
 
 
138 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  29.92 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  29.27 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  28.81 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>