56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2858 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  29.2 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  33.81 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  27.15 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2238  hypothetical protein  36.94 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  30.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  29.71 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  25.87 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  34.09 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  27.01 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  27.41 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  34.83 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  26.57 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  26.12 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  26.12 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  34.83 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  26.12 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.84 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  32.18 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  28.8 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  31.03 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  31.03 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  31.03 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  31.03 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  31.15 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  26.03 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  22.6 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  27.82 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  29.89 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  26 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  29.2 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  29.89 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  29.89 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  26.12 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  25.17 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  25.17 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  25.74 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  29.25 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  24.5 
 
 		 176 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  25.85 
 
 		 175 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  24.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  24.32 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  27.68 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  27.68 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>