19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4972 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4972  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3188  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4291  hypothetical protein  99.38 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0125  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84994  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2108  hypothetical protein  51.33 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.845076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  46.41 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  46.75 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  28.99 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  24.09 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  23.96 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  26.73 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  24.75 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  23.96 
 
 		 138 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  23.96 
 
 		 138 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  28.85 
 
 		 149 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  23.96 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  25.49 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2858  hypothetical protein  27.68 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>