107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2657 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  257  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  58.88 
 
 
134 aa  142  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  55.77 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  54.63 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  54.63 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  54.63 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  52.68 
 
 
116 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  54.21 
 
 
150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  54.63 
 
 
116 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  50.93 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  50.93 
 
 
116 aa  121  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  50.93 
 
 
116 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  50.93 
 
 
116 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  49.54 
 
 
117 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  50.96 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  53.77 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  48.57 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  45.19 
 
 
132 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  39.62 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  39.62 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  39.62 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  37.74 
 
 
121 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  41.51 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  39.05 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  41.44 
 
 
129 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  46.74 
 
 
123 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  44.34 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  40.86 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  41.94 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  41.94 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  42.22 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  45.56 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  44.44 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  39.13 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  40.38 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  41.67 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  41.11 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  40.59 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  40.59 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  36.94 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  37.89 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  32.17 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  44.58 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  37.36 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  32.17 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  32.17 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  33.94 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  36.08 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  43 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  32.32 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  32.32 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  31.31 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  32 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  32 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  31.31 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  31.86 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  31.31 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  31.31 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  35.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  31.31 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  33.68 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  29.47 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  36.54 
 
 
140 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  32.26 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  32.39 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  35.21 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  31.94 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  26.44 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  31.33 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  32.39 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  28.43 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  28.72 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  38.3 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  28.57 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  39.29 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  36.84 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  40.43 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  38.1 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  40.54 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  29.59 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  34.41 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  39.47 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  31.58 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  37.21 
 
 
138 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  27.18 
 
 
133 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  26.47 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  26.47 
 
 
98 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  29.89 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  34.48 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  31.67 
 
 
323 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  30.14 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>