More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0422 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  100 
 
 
371 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  83.15 
 
 
371 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  61.6 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  60.16 
 
 
389 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  55.94 
 
 
389 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  52.17 
 
 
394 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  51.41 
 
 
401 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  50 
 
 
398 aa  332  8e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  53.28 
 
 
400 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  48.97 
 
 
400 aa  329  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  46.89 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  51.06 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  49.74 
 
 
396 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  49.87 
 
 
402 aa  322  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  48.32 
 
 
398 aa  319  6e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  46.91 
 
 
392 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  49.62 
 
 
402 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  46.31 
 
 
393 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  48.6 
 
 
411 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  48.71 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  48.69 
 
 
402 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  48.98 
 
 
416 aa  308  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  45.74 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  46.39 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  48.82 
 
 
396 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  48.58 
 
 
401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  43.54 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  44.79 
 
 
404 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  48.81 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  47.99 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  46.77 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  46.12 
 
 
407 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  47.63 
 
 
397 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  46.94 
 
 
399 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  46.88 
 
 
390 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  48.03 
 
 
412 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  50.65 
 
 
1230 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  47.03 
 
 
396 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  47.03 
 
 
396 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  48.18 
 
 
410 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  46.07 
 
 
393 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  46.94 
 
 
403 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  42.75 
 
 
403 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  46.72 
 
 
392 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  46.98 
 
 
394 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  46.23 
 
 
402 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  45.2 
 
 
405 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  48.43 
 
 
402 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  48.43 
 
 
402 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  46.86 
 
 
395 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  45.03 
 
 
393 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  46.28 
 
 
393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  46.28 
 
 
393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  45 
 
 
396 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  45.65 
 
 
392 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  46.84 
 
 
400 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  47.23 
 
 
392 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  48.18 
 
 
1305 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  45.03 
 
 
391 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  46.7 
 
 
392 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  46.7 
 
 
392 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  47 
 
 
405 aa  285  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  46.7 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  46.7 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  46.7 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  49.09 
 
 
1228 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  48.4 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  42.46 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  42.75 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  49.87 
 
 
1230 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  48.14 
 
 
399 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  45.79 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  52.82 
 
 
391 aa  281  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  50.84 
 
 
397 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  43.75 
 
 
382 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  45.04 
 
 
412 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  50.61 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  44.47 
 
 
391 aa  271  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  43.8 
 
 
397 aa  270  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  46.61 
 
 
413 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  42.44 
 
 
394 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  45.05 
 
 
397 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  38.85 
 
 
408 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  45.79 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  40.1 
 
 
396 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  50.34 
 
 
385 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5006  hypothetical protein  43.86 
 
 
385 aa  255  9e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.9079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  38.97 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  47.4 
 
 
407 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  46.18 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  44.3 
 
 
358 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  39.33 
 
 
397 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  39.07 
 
 
397 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  43.27 
 
 
392 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01770  acetate kinase  42.71 
 
 
388 aa  249  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.23 
 
 
401 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  38.56 
 
 
397 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  38.56 
 
 
397 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  38.56 
 
 
397 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>