44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4870 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  93.38 
 
 		 408 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  94.61 
 
 		 408 aa  748    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  805    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  82.09 
 
 		 411 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  73.15 
 
 		 402 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  48.49 
 
 		 367 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  48.91 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  48.23 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  47.11 
 
 		 427 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  50.14 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  47.38 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  47.38 
 
 		 422 aa  315  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  48.29 
 
 		 423 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  45.56 
 
 		 423 aa  292  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  42.93 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.96 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.96 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  41.34 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  46.2 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  41.74 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  41.6 
 
 		 393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  42.27 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  40.21 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  38.37 
 
 		 408 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  42.58 
 
 		 369 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  42.3 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  40.26 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  36.81 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  37.87 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.31 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  39.88 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  39.89 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  41.26 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  44.4 
 
 		 402 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  41.29 
 
 		 391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  24.61 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  24.73 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  22.47 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  22.06 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>