More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3395 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
226 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  91.15 
 
 
226 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  91.15 
 
 
226 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  69.4 
 
 
232 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  64.94 
 
 
231 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  67.56 
 
 
224 aa  238  6e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  54.31 
 
 
234 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  56.11 
 
 
259 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  54.87 
 
 
227 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  52.4 
 
 
231 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  51.38 
 
 
232 aa  184  1e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  51.58 
 
 
231 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  51.38 
 
 
232 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  50.23 
 
 
233 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  50.22 
 
 
230 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  47.56 
 
 
231 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  40.89 
 
 
220 aa  140  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
220 aa  139  4e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  40 
 
 
261 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  40 
 
 
261 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  37.73 
 
 
229 aa  127  2e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  37.39 
 
 
229 aa  120  1e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  39.91 
 
 
218 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50711e-06 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  41.67 
 
 
213 aa  110  1e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  36.99 
 
 
225 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  43.24 
 
 
230 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  37.77 
 
 
231 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  35.04 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  36.74 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  38.36 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  33.19 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  33.19 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  40.27 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  33.19 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  33.19 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  33.19 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  37.3 
 
 
232 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  34.71 
 
 
233 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  37.3 
 
 
232 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  37.3 
 
 
232 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  36.11 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  2.68833e-06 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  34.23 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  32.16 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  35.77 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  34.35 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  32.53 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  34.55 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  33.91 
 
 
224 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  33.91 
 
 
224 aa  84.7  1e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.11 
 
 
233 aa  84.3  1e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  29.63 
 
 
236 aa  84.3  1e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.31 
 
 
231 aa  84  2e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  34.31 
 
 
231 aa  84  2e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.8735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  35.71 
 
 
233 aa  84  2e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  34.31 
 
 
231 aa  84  2e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  34.31 
 
 
231 aa  84  2e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  39.74 
 
 
238 aa  83.6  2e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  34.31 
 
 
231 aa  84  2e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  34.31 
 
 
231 aa  84  2e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  34.31 
 
 
231 aa  84  2e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  33.58 
 
 
231 aa  83.2  3e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  33.61 
 
 
237 aa  83.2  3e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  32.46 
 
 
224 aa  83.2  3e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  40.16 
 
 
222 aa  82.8  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  37.31 
 
 
238 aa  82.8  4e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  40.16 
 
 
222 aa  82.8  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  31.11 
 
 
237 aa  82.4  5e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  30.66 
 
 
239 aa  81.3  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  33.77 
 
 
233 aa  81.3  1e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  32.47 
 
 
233 aa  81.3  1e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  36.32 
 
 
233 aa  81.3  1e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  28.76 
 
 
241 aa  81.3  1e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  33.11 
 
 
233 aa  80.9  2e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  32.26 
 
 
230 aa  80.9  2e-14  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  35.81 
 
 
231 aa  80.1  3e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  36.51 
 
 
247 aa  79.3  4e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  34.92 
 
 
239 aa  79.3  4e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  33.77 
 
 
223 aa  79.7  4e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  30 
 
 
241 aa  79.7  4e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  32.61 
 
 
229 aa  79  6e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  33.83 
 
 
236 aa  78.6  7e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  30 
 
 
233 aa  78.6  8e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  34.88 
 
 
231 aa  78.6  8e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  32.5 
 
 
227 aa  78.2  9e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  29.68 
 
 
233 aa  78.2  1e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  26.83 
 
 
241 aa  78.2  1e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  3.59774e-07 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  32.28 
 
 
237 aa  77.8  1e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  35.82 
 
 
236 aa  77.8  1e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  35.82 
 
 
236 aa  78.2  1e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  33.87 
 
 
232 aa  77  2e-13  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  77  2e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  36.69 
 
 
229 aa  77.4  2e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  32.54 
 
 
230 aa  76.6  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  29.35 
 
 
239 aa  76.6  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  32.87 
 
 
241 aa  75.9  4e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  35.82 
 
 
236 aa  75.9  4e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  34.07 
 
 
228 aa  76.3  4e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.68 
 
 
234 aa  75.9  5e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  39.68 
 
 
223 aa  75.9  5e-13  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  38.01 
 
 
210 aa  75.5  6e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>