34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0020 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0020  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0218  hypothetical protein  88.89 
 
 		 172 aa  307  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0162  hypothetical protein  87.72 
 
 		 172 aa  305  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6225  hypothetical protein  74.71 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6891  hypothetical protein  59.06 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4185  hypothetical protein  50.88 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5822  hypothetical protein  61.68 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  hitchhiker  0.00751047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1240  transmembrane prediction  42.68 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.861409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1593  transmembrane prediction  38.69 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3384  transmembrane prediction  37.06 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1465  hypothetical protein  41.07 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4142  hypothetical protein  40.99 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0798  transmembrane prediction  39.77 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0843  transmembrane prediction  39.77 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2711  hypothetical protein  43.62 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0850  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  39.18 
 
 		 175 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0846  conserved hypothetical protein-transmembrane prediction  38.6 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0224  hypothetical protein  36.81 
 
 		 217 aa  98.2  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.478413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4430  transmembrane prediction  40 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0768984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3001  transmembrane prediction  36.55 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988417 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5953  transmembrane prediction  40.69 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3932  hypothetical protein  29.24 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0284827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3985  hypothetical protein  34.32 
 
 		 477 aa  82.4  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  28.99 
 
 		 499 aa  70.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1042  polysulphide reductase NrfD  32.86 
 
 		 674 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0482955  normal  0.0753031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0291  hypothetical protein  23.39 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0563364  hitchhiker  0.000442297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  29.3 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0833  hypothetical protein  35.63 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.164665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0526  hypothetical protein  24.4 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  28.66 
 
 		 624 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2210  hypothetical protein  25.93 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3474  quinol:cytochrome c oxidoreductase membrane protein  22.38 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.19087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1637  hypothetical protein  26.44 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5667  hypothetical protein  24.32 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>