189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1938 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1938  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.186563  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1987  hypothetical protein  77.25 
 
 
213 aa  343  8e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  44.17 
 
 
436 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  47.55 
 
 
390 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  47.98 
 
 
392 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1683  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  45.81 
 
 
392 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.81 
 
 
380 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1063  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  45.67 
 
 
392 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  40.87 
 
 
404 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.55 
 
 
402 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1666  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.61 
 
 
385 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357019  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  45.88 
 
 
370 aa  160  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1402  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.12 
 
 
385 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  42.08 
 
 
400 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0806  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.87 
 
 
414 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11930  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44 
 
 
420 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000175625  normal  0.0434054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.31 
 
 
400 aa  157  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.5 
 
 
414 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.84 
 
 
422 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.08 
 
 
401 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44.62 
 
 
361 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07780  thiazole biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41 
 
 
410 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.680526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.91 
 
 
398 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22060  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.37 
 
 
396 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.733648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.09 
 
 
389 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.1 
 
 
401 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661322  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40 
 
 
429 aa  151  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.84 
 
 
385 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  43.84 
 
 
398 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1658  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.12 
 
 
405 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151293  hitchhiker  0.00140445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4478  thiamine biosynthesis protein ThiI  46.04 
 
 
403 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2351  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.67 
 
 
413 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0925  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.82 
 
 
387 aa  148  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000171827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  43.9 
 
 
391 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1279  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.23 
 
 
407 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0186014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  44.56 
 
 
369 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0819  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44.27 
 
 
394 aa  146  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0479  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.54 
 
 
404 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000040209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0731  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.78 
 
 
388 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.05 
 
 
404 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.55 
 
 
404 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.55 
 
 
404 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.55 
 
 
404 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.55 
 
 
403 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.96 
 
 
383 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4756  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.55 
 
 
404 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4381  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.06 
 
 
404 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4782  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.06 
 
 
404 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1771  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.76 
 
 
407 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1806  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.76 
 
 
407 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1223  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.65 
 
 
405 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000164675  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  41.94 
 
 
383 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3319  thiamine biosynthesis protein ThiI  44.55 
 
 
403 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1330  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.29 
 
 
392 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000522414  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1272  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.29 
 
 
392 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000028573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1372  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.9 
 
 
404 aa  142  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000114319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  36.59 
 
 
387 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0451  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.9 
 
 
407 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.21 
 
 
389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.91 
 
 
392 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.32 
 
 
383 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.54 
 
 
484 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0664  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.31 
 
 
385 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  38.57 
 
 
393 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  36.89 
 
 
335 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  35.15 
 
 
400 aa  133  3e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.37 
 
 
406 aa  131  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000116963  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1110  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  44.51 
 
 
376 aa  131  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.142781  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  40.64 
 
 
406 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.61 
 
 
371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1035  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.1 
 
 
422 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.533687  normal  0.416754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  37.95 
 
 
502 aa  128  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1320  thiamine biosynthesis protein  46.77 
 
 
309 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3460  Thiamine biosynthesis protein-like protein  39.11 
 
 
392 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  38.24 
 
 
392 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.2 
 
 
472 aa  123  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0239  thiamine biosynthesis protein ThiI  36 
 
 
395 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0302483  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0463  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.47 
 
 
392 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.78 
 
 
474 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.13 
 
 
500 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.05 
 
 
381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.11 
 
 
416 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2568  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.08 
 
 
387 aa  112  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.05 
 
 
484 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  35.59 
 
 
407 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.16 
 
 
484 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  33.67 
 
 
395 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.87 
 
 
473 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.17 
 
 
475 aa  105  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.49 
 
 
484 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.52 
 
 
484 aa  104  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.53 
 
 
484 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.67 
 
 
484 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.75 
 
 
493 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.82 
 
 
484 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.82 
 
 
484 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.52 
 
 
485 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.82 
 
 
484 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.82 
 
 
484 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.35 
 
 
482 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>