227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0554 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  100 
 
 		 102 aa  210  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  76.47 
 
 		 102 aa  174  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  73 
 
 		 102 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  45.54 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  44.55 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  40.59 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1635  ferredoxin, 2Fe-2S  44.12 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  46.08 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  43.69 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  47.87 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1759  ferredoxin, 2Fe-2S  41.18 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.370583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  41.75 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  44.33 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1957  ferredoxin, 2Fe-2S  42.16 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  39.18 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  43.3 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  39.18 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  39.18 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  45.1 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  40.21 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  42.16 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  38.14 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  38.3 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  42.42 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  39.81 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.71 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  37.25 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  36.08 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  37.11 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  35.05 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  44.87 
 
 		 596 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  48.48 
 
 		 598 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34.65 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  38.54 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  36.63 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1150  ferredoxin, 2Fe-2S  37.25 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  37.62 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  37.62 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3095  ferredoxin, 2fe-2s  37.25 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  32.32 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  43.59 
 
 		 641 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  34.34 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  36.63 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  34.34 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  34.34 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  39.8 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  36.63 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  34.34 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  35.58 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  33.67 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  36.63 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 		 597 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  39.74 
 
 		 594 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2619  ferredoxin, 2Fe-2S  38.95 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0840  ferredoxin, 2fe-2s  38.3 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  30.56 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  36 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  36 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  36 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  41.05 
 
 		 596 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  32.32 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  34.65 
 
 		 597 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  37.62 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  39.19 
 
 		 614 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  35 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  35 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  37.74 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  37.74 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  31.48 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.98 
 
 		 677 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  34 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  39.74 
 
 		 640 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  43.59 
 
 		 635 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0282  ferredoxin, 2Fe-2S  33.73 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  34.65 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  36.79 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 636 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  34.31 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  36.63 
 
 		 597 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  35 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 614 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  34.65 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  32.32 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  36.08 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.31 
 
 		 636 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.63 
 
 		 569 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  34.65 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  34 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 		 595 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 		 597 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12171  ferredoxin  27.45 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.745288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>