279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4022 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  100 
 
 		 330 aa  673    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  82.87 
 
 		 323 aa  524  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  82.72 
 
 		 274 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  57.93 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  58.05 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  84.52 
 
 		 157 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  38.48 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  38.48 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  38.2 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  37.58 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  35.26 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  35.26 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  36.62 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  36.11 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  36.11 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  36.11 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 463 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  33.53 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  33.53 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  33.53 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  33.64 
 
 		 441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  33.64 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  33.64 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  33.64 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  33.64 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  33.64 
 
 		 497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  30.65 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  32.33 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  29.93 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  30.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  30.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  30.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  30.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  30.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  30.6 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  31.63 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  28.79 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  32.18 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  32.18 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  32.18 
 
 		 330 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  31.56 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  30 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  31.13 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  40.1 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  33.85 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  30.15 
 
 		 463 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  31.86 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  31.86 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  28.53 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  28.31 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  30.38 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  30.38 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  30.38 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  30.38 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  29.43 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  29.19 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  36.54 
 
 		 216 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  36.54 
 
 		 216 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 277 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 179 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  28.83 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  30.85 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  29.07 
 
 		 286 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  29.07 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  29.95 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  31.18 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  35.64 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  29.34 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  29.34 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  29.34 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  29.34 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  29.34 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  28.68 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  30.29 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  32.16 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  30.43 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  30.86 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  30.71 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  30.51 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>