More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3668 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  100 
 
 
452 aa  922    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  36.22 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.87 
 
 
453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  39.95 
 
 
436 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  38.82 
 
 
451 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  38.34 
 
 
446 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.54 
 
 
448 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.28 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.03 
 
 
462 aa  253  6e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  37.56 
 
 
427 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  39.86 
 
 
434 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  36.18 
 
 
452 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  37.13 
 
 
439 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  37.42 
 
 
464 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.83 
 
 
444 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  35.25 
 
 
451 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  34.86 
 
 
451 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  37.02 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  36.73 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.29 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.35 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.9 
 
 
448 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  33.72 
 
 
455 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  34.07 
 
 
435 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  37.53 
 
 
427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.07 
 
 
429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  38.05 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.07 
 
 
429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  32.88 
 
 
443 aa  240  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.19 
 
 
452 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.18 
 
 
429 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  36.91 
 
 
428 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  35.86 
 
 
426 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  37.14 
 
 
428 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  34.06 
 
 
462 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  36.69 
 
 
429 aa  237  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  37.14 
 
 
428 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  34.59 
 
 
431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  34.44 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  36.91 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.24 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  37 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  36.02 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  35.81 
 
 
425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  35.46 
 
 
468 aa  233  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  34.51 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  36.47 
 
 
428 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  36.65 
 
 
444 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.44 
 
 
448 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.51 
 
 
429 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  34.66 
 
 
429 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.19 
 
 
448 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  36.41 
 
 
444 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  34.99 
 
 
426 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  33.55 
 
 
429 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.44 
 
 
429 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  36.17 
 
 
444 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  36.41 
 
 
444 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.01 
 
 
446 aa  230  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.22 
 
 
429 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  35.71 
 
 
429 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  36.41 
 
 
444 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  36.17 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  36.17 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  35.92 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  36.17 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  36.17 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 
431 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.89 
 
 
459 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.53 
 
 
434 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  35.49 
 
 
429 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.71 
 
 
449 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.17 
 
 
430 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.17 
 
 
430 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  35.12 
 
 
444 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  30.98 
 
 
449 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  33.56 
 
 
445 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  34.99 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.9 
 
 
450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  35.49 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  34.58 
 
 
429 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  34.58 
 
 
429 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  34.58 
 
 
429 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  34.58 
 
 
429 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  35.01 
 
 
450 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  34.58 
 
 
429 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.78 
 
 
452 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  35.89 
 
 
450 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  34.36 
 
 
429 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  34.36 
 
 
429 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  33.99 
 
 
429 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  34.36 
 
 
429 aa  222  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  35.35 
 
 
451 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  31.56 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  37.76 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  36.41 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  33.99 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  33.92 
 
 
429 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  36.59 
 
 
448 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  33.56 
 
 
427 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>