More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0503 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  100 
 
 		 462 aa  920    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  57.61 
 
 		 452 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  57.17 
 
 		 452 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  57.62 
 
 		 453 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  57.3 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  56.99 
 
 		 453 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  59.2 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  56.09 
 
 		 449 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  57.17 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  58.35 
 
 		 453 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  58.37 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  56.95 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  55.08 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  55.08 
 
 		 458 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  56.19 
 
 		 451 aa  491  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  56.98 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  56.94 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  59.2 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  55.7 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  58.1 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  57.34 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  57.34 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  58.73 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  58.73 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  58.35 
 
 		 453 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  57.68 
 
 		 459 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  58.73 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  58.73 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  58.35 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  56.48 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  54.86 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  58.25 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  58.73 
 
 		 453 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  58.35 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  55.24 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  55.02 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  54.96 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.67 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  54.65 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  58.23 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  54.33 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  55.7 
 
 		 457 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  56.8 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  57.67 
 
 		 453 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  56.95 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  55.26 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  55.92 
 
 		 457 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  56.65 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  57.67 
 
 		 453 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  60 
 
 		 456 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  54.42 
 
 		 461 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  57.34 
 
 		 453 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  56.56 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  55.32 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  55.32 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  55.32 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  54.65 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03481  hypothetical protein  59.76 
 
 		 460 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  54.78 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002535  signal recognition particle subunit Ffh SRP54  60.24 
 
 		 460 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.08 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  55.68 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  55.71 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  55.32 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  58.73 
 
 		 453 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000129048  hitchhiker  0.0000234744 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.42 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  54.48 
 
 		 515 aa  475  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  55.09 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  55.09 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  55.32 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  55.56 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.35 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  56.4 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  54.61 
 
 		 452 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56.16 
 
 		 447 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  55.09 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.46 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  55.09 
 
 		 449 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  56.14 
 
 		 457 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0094  signal recognition particle protein  58.81 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000225089  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  55.58 
 
 		 455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  56.26 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  55.58 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  57.52 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  54.16 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0648  signal recognition particle protein  57.14 
 
 		 461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.773728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  55.58 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  56.26 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  56.26 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  56.26 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  55 
 
 		 492 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  50 
 
 		 511 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>