60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0586 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 395 aa  797    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  26.49 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  32.8 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  29.76 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  31.35 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  28.78 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  27.1 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  24.82 
 
 		 418 aa  89.7  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  26.72 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  23.57 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  21.78 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  22.41 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  21.2 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  21.2 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  25.62 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  25.18 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  21.2 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  21.2 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  21.15 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  21.2 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  20.83 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  21.2 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  22.13 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  18.81 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  21.71 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  18.48 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  18.48 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  18.48 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  18.48 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.23 
 
 		 745 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  25.12 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  23.59 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  22.42 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  25.65 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  21.89 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  22.41 
 
 		 745 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  22.06 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  20.61 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  24.4 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  24 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  24.15 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  24.15 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  24.02 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  21.02 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  24.15 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  24.47 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  23.67 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  21.27 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  23.6 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  24.47 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  23.94 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  20.24 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  23.47 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.22 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  20.42 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  21.78 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  21.7 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0729  hypothetical protein  26.62 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  22.49 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  22.06 
 
 		 350 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>