More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0061 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  92.78 
 
 
443 aa  832  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  886  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  81.78 
 
 
439 aa  733  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  92.48 
 
 
439 aa  805  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  64.17 
 
 
447 aa  572  1e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  41.72 
 
 
437 aa  363  4e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  37.92 
 
 
505 aa  333  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  44.33 
 
 
288 aa  259  6e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  35.77 
 
 
276 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
274 aa  173  6e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 
274 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  34.08 
 
 
287 aa  165  1e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
288 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.37716e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  32.59 
 
 
283 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
287 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.25812e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  34.62 
 
 
288 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.5 
 
 
379 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 
279 aa  137  3e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.47 
 
 
383 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.78 
 
 
379 aa  134  2e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.71 
 
 
375 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.32 
 
 
377 aa  132  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.36 
 
 
379 aa  132  1e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.99 
 
 
384 aa  132  1e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  30.42 
 
 
375 aa  131  2e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
373 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
373 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
373 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
373 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
373 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.08785e-05  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
373 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
373 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.76639e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
373 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
373 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
373 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  29.5 
 
 
373 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.37 
 
 
384 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
373 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 
375 aa  130  4e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  29.02 
 
 
242 aa  130  4e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  29.5 
 
 
373 aa  129  8e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
373 aa  128  2e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 
375 aa  127  4e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
373 aa  127  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
373 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
373 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 
373 aa  126  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
379 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.0953e-05  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
383 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 
374 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
379 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
379 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.24 
 
 
384 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
373 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
379 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.09 
 
 
373 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
383 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.15 
 
 
383 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 
373 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 
379 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.66 
 
 
383 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
373 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 
372 aa  122  1e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 
384 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
381 aa  113  8e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  27.15 
 
 
706 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  24.92 
 
 
371 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.95 
 
 
375 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  27.14 
 
 
373 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  24.01 
 
 
375 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 
373 aa  103  9e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
294 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  26.42 
 
 
283 aa  100  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.69 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  28.05 
 
 
237 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  23.66 
 
 
375 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  28.45 
 
 
346 aa  90.1  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.64 
 
 
308 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  23.7 
 
 
351 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.37 
 
 
314 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.25 
 
 
313 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  26.07 
 
 
281 aa  88.2  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.95 
 
 
313 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  28.43 
 
 
245 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.46 
 
 
311 aa  85.9  1e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  25.3 
 
 
295 aa  85.9  1e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.81 
 
 
312 aa  85.5  2e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.11 
 
 
311 aa  85.5  2e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 
293 aa  85.1  2e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 
293 aa  85.1  2e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.92 
 
 
311 aa  83.6  6e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.14 
 
 
307 aa  83.6  6e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  25.93 
 
 
288 aa  83.2  8e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.0742e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  25.7 
 
 
254 aa  83.2  8e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  23.57 
 
 
364 aa  83.2  9e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.25 
 
 
312 aa  82.4  1e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.53 
 
 
314 aa  82.4  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  25.62 
 
 
367 aa  81.6  2e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.33 
 
 
742 aa  81.3  3e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>