More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1650 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
571 aa  1157    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 
570 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  41.34 
 
 
553 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 
584 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 
582 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
569 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  38.24 
 
 
601 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
590 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
591 aa  363  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 
583 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
587 aa  343  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
570 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 
574 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
578 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
512 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
521 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
527 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
500 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 
509 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.02 
 
 
515 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
490 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 
521 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 
565 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 
511 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 
583 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
501 aa  256  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
506 aa  249  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.04 
 
 
561 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.12 
 
 
582 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 
527 aa  247  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 
506 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.29 
 
 
561 aa  247  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
502 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 
561 aa  246  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.75 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
662 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
539 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 
518 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.26 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.75 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 
508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.7 
 
 
529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.01 
 
 
526 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 
512 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 
557 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
510 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.62 
 
 
510 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 
510 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 
510 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 
510 aa  243  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.39 
 
 
561 aa  243  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 
510 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 
502 aa  242  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 
510 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.78 
 
 
514 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 
536 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 
519 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 
511 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 
582 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 
510 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 
563 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 
563 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 
513 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.4 
 
 
561 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
545 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
566 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
506 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.24 
 
 
644 aa  238  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  35.49 
 
 
508 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.55 
 
 
512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.14 
 
 
525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
519 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
492 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
498 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  30.92 
 
 
514 aa  234  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 
551 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
522 aa  233  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 
525 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
545 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
513 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.12 
 
 
533 aa  233  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
525 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.09 
 
 
516 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.82 
 
 
500 aa  232  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.73 
 
 
552 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 
514 aa  231  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.46 
 
 
510 aa  231  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
520 aa  230  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 
510 aa  229  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>