More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0147 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 448 aa  862    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  39.22 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  39.68 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  43.36 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  43.12 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  39.05 
 
 		 445 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  37.91 
 
 		 460 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  44.68 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 435 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  38.06 
 
 		 441 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  37.24 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  34.73 
 
 		 476 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  37.5 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  31.72 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  34.99 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  31.34 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  34.99 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  34.99 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  34.86 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  34.99 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  34.74 
 
 		 445 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  34.08 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  34.08 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  34.08 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  30.7 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  34.24 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  34.24 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  34.24 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  34.24 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  34.24 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  34.24 
 
 		 445 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  34.24 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 474 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  34 
 
 		 445 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  31.81 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  31.55 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  31.78 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  31.55 
 
 		 465 aa  163  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  32.24 
 
 		 509 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  31.99 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  31.55 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  31.78 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  31.57 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  31.57 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  31.57 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  31.04 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  31.57 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  31.57 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  30.34 
 
 		 467 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  31.04 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  31.04 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  31.57 
 
 		 474 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 		 474 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  31.04 
 
 		 465 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  31.57 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  32.74 
 
 		 506 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  32.23 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  32.23 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  32.74 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  32.23 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  32.23 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  32.23 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  30.79 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  30.79 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  33.18 
 
 		 489 aa  153  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3768  lysine/cadaverine antiporter  35.56 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000519797  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2759  lysine/cadaverine antiporter  35.08 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2934  lysine/cadaverine antiporter  35.08 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.252343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2717  lysine/cadaverine antiporter  35.08 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2800  lysine/cadaverine antiporter  35.08 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.1623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2821  lysine/cadaverine antiporter  35.08 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  32.44 
 
 		 493 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  30.99 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  30.99 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  31.71 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  32.03 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  31.53 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  32.1 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  32.1 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  30.07 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0537  amino acid permease-associated region  32.24 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  31.85 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  33.24 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  31.6 
 
 		 471 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  31.85 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  30.71 
 
 		 439 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  31.78 
 
 		 475 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  29.52 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  32.14 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  31.87 
 
 		 475 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  32.03 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2492  lysine/cadaverine antiporter  32.04 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  31.87 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00206  lysine/cadaverine antiporter  33.23 
 
 		 448 aa  140  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  30.94 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  32.51 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  30.02 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  30.02 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>