More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4385 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  83.96 
 
 		 482 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  90.53 
 
 		 475 aa  808    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  79.52 
 
 		 475 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  78.95 
 
 		 480 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  78.89 
 
 		 493 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  80.42 
 
 		 475 aa  712    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 486 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  76 
 
 		 475 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 486 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  88.42 
 
 		 475 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 506 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  79.37 
 
 		 475 aa  718    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  100 
 
 		 475 aa  929    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  91.37 
 
 		 475 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 486 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  78.74 
 
 		 475 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  79.24 
 
 		 484 aa  703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 486 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 486 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  84.17 
 
 		 482 aa  730    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  90.32 
 
 		 475 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  90.74 
 
 		 475 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 506 aa  741    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  83.76 
 
 		 486 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  79.37 
 
 		 475 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  55.01 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  60.93 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  61.4 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  56.96 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  59.49 
 
 		 496 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  59.49 
 
 		 671 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  59.75 
 
 		 663 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  57.47 
 
 		 473 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  61.49 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2174  arginine/ornithine antiporter  58.28 
 
 		 492 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  54.11 
 
 		 478 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  51.41 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  54.35 
 
 		 478 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  53.7 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  53.49 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  53.07 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  53.28 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  53.49 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  48.62 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  48.83 
 
 		 471 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  49.68 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  52 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  49.04 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  49.04 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  49.04 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  49.04 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  49.04 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  48.63 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04620  amino acid transporter  52.13 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  49.68 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  49.46 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  50.42 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  48.6 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1190  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  54.22 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.430396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1038  amino acid permease  54.22 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.200212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0019  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  54.22 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.991696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0393  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  54.22 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  49.15 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  49.25 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  49.25 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48850  amino acid permease  50.34 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176582  hitchhiker  0.0000000102328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4184  amino acid permease  50.34 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  46.45 
 
 		 460 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  45.81 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1586  arginine/ornithine antiporter  47.1 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916366  normal  0.560128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1577  arginine/ornithine antiporter  47.1 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933609  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1645  arginine/ornithine antiporter  46.88 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.498381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1697  arginine/ornithine antiporter  47.1 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1847  arginine/ornithine antiporter  49.54 
 
 		 460 aa  392  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.861199  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  48.29 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19660  amino acid transporter  43.13 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.598137  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0744  arginine/ornithine antiporter  44.25 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  47.05 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  46.15 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  47.05 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  47.05 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2906  amino acid permease-associated region  43.14 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3864  amino acid permease-associated region  48.83 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3099  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1278  amino acid permease-associated region  49.64 
 
 		 466 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0546125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3089  amino acid permease-associated region  49.64 
 
 		 466 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3242  amino acid permease-associated region  49.4 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2970  amino acid permease-associated region  42.77 
 
 		 494 aa  350  4e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3333  amino acid permease-associated region  44.42 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0377  putative arginine/ornithine antiporter  40.04 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0372  arginine/ornithine antiporter  39.83 
 
 		 481 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11790  amino acid transporter  46.4 
 
 		 472 aa  329  6e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14000  amino acid transporter  41.25 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>