More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1002 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4221  arginine/ornithine antiporter  96 
 
 		 475 aa  824    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4222  arginine/ornithine antiporter  77.47 
 
 		 475 aa  689    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1002  arginine/ornithine antiporter  76.84 
 
 		 475 aa  691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1003  arginine/ornithine antiporter  98.74 
 
 		 475 aa  922    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1988  arginine/ornithine antiporter  76.6 
 
 		 486 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1109  arginine/ornithine antiporter  75.37 
 
 		 475 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.28189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1001  arginine/ornithine antiporter  77.89 
 
 		 475 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2660  arginine/ornithine antiporter  79.79 
 
 		 475 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1144  arginine/ornithine antiporter  76.6 
 
 		 486 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2683  arginine/ornithine antiporter  76.84 
 
 		 475 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2129  arginine/ornithine antiporter  76.6 
 
 		 506 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4384  arginine/ornithine antiporter  84.63 
 
 		 475 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.669533  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4385  arginine/ornithine antiporter  79.37 
 
 		 475 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4536  arginine/ornithine antiporter  73.4 
 
 		 484 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0916  arginine/ornithine antiporter  76.6 
 
 		 486 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2383  arginine/ornithine antiporter  76.81 
 
 		 486 aa  678    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1040  arginine/ornithine antiporter  98.74 
 
 		 480 aa  923    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1089  arginine/ornithine antiporter  73.56 
 
 		 493 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.505428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1002  arginine/ornithine antiporter  100 
 
 		 475 aa  931    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68300  arginine/ornithine antiporter  74.79 
 
 		 482 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000378428  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1039  arginine/ornithine antiporter  76.84 
 
 		 475 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5910  arginine/ornithine antiporter  75.42 
 
 		 482 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0569669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1584  arginine/ornithine antiporter  76.6 
 
 		 506 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0243  arginine/ornithine antiporter  76.6 
 
 		 486 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1969  arginine/ornithine antiporter  76.6 
 
 		 486 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2905  arginine/ornithine antiporter  60.21 
 
 		 473 aa  519  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  60.63 
 
 		 496 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  52.55 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1878  arginine/ornithine APC family antiporter  60.45 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  60.09 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5574  arginine/ornithine antiporter  59.1 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0072  amino acid permease  56.6 
 
 		 671 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1484  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  56.6 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0574434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1571  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  57.24 
 
 		 663 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0188747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04620  amino acid transporter  54.33 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2174  arginine/ornithine antiporter  57.65 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0163  arginine/ornithine antiporter  52.88 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0159  arginine/ornithine antiporter  52.55 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  48.72 
 
 		 475 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06670  arginine/ornithine antiporter  49.67 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.477443  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  47.78 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  49.14 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  47.98 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  48.2 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  48.71 
 
 		 475 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  50.43 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  50.43 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  48.71 
 
 		 475 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  48.71 
 
 		 475 aa  435  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  50.43 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  48.07 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  48.71 
 
 		 475 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  48.71 
 
 		 475 aa  435  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  50.21 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3061  arginine/ornithine antiporter  48.5 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  50.43 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2851  arginine/ornithine antiporter  49.47 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000722534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0350  arginine/ornithine antiporter  49.68 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2247  arginine/ornithine antiporter  44.95 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1190  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  52.13 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.430396  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1038  amino acid permease  52.13 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.200212  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0019  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  52.13 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.991696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0393  basic amino acid/polyamine antiporter (APA) family protein  52.13 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2657  arginine/ornithine antiporter  45.32 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2713  arginine/ornithine antiporter  45.32 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2315  arginine/ornithine antiporter  46.71 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1680  putative arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.982096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01574  predicted arginine/ornithine antiporter transporter  46.5 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.424719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2038  arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000756362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2025  arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01564  hypothetical protein  46.5 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.358572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1813  putative arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00102354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1594  arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1791  arginine/ornithine antiporter  46.28 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0468427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4184  amino acid permease  51.13 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48850  amino acid permease  50.33 
 
 		 472 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176582  hitchhiker  0.0000000102328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1577  arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933609  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1645  arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.498381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1697  arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1586  arginine/ornithine antiporter  46.5 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916366  normal  0.560128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1847  arginine/ornithine antiporter  47.99 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.861199  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2587  arginine/ornithine antiporter  46.15 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19660  amino acid transporter  41.49 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.598137  normal  0.230727 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0744  arginine/ornithine antiporter  43.28 
 
 		 503 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1828  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  44.49 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.768875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1939  arginine/ornithine antiporter  44.49 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2298  putative arginine/ornithine antiporter ArcD  44.49 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.552138 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1498  amino acid permease-associated region  44.37 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333437  normal  0.389664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3333  amino acid permease-associated region  44.21 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2906  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 		 500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3864  amino acid permease-associated region  47.28 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3099  amino acid permease-associated region  48.24 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11790  amino acid transporter  46.3 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3089  amino acid permease-associated region  48.35 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1278  amino acid permease-associated region  48.11 
 
 		 466 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0546125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3242  amino acid permease-associated region  47.88 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2970  amino acid permease-associated region  41.41 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14000  amino acid transporter  40.17 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0377  putative arginine/ornithine antiporter  38.85 
 
 		 481 aa  322  7e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0372  arginine/ornithine antiporter  38.22 
 
 		 481 aa  320  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>