27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1173 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  358  3e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  46.71 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  40.83 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  36.42 
 
 		 162 aa  84.7  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  34.08 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  34.27 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  32.54 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  33.73 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>