54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4070 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4070  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  306  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322816  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  34.91 
 
 
120 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  25.83 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  28.8 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  25.69 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  25.69 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.17 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  26.47 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  26.61 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  28.7 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  29.25 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.71 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  27.19 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  26.09 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  26.09 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  27.83 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  32.29 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  24.59 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  30.69 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  28.05 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  31.82 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  25.62 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.17 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  27.78 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  25.96 
 
 
132 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28.45 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  26.61 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  33.7 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  27.62 
 
 
132 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.32 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  25.6 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  27.88 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  27.97 
 
 
321 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  28.06 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  26.05 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  27.59 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  25.23 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  28.45 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  26.92 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  26.98 
 
 
417 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>