More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3878 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  86.81 
 
 
146 aa  253  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  85.42 
 
 
147 aa  252  1e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  85.42 
 
 
147 aa  252  1e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  85.42 
 
 
147 aa  252  1e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  84.03 
 
 
146 aa  247  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  66.67 
 
 
145 aa  193  5e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  67.38 
 
 
145 aa  192  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  66.67 
 
 
165 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  66.91 
 
 
149 aa  190  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  66.91 
 
 
143 aa  191  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  67.15 
 
 
148 aa  187  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  67.15 
 
 
144 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  63.01 
 
 
146 aa  186  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  62.41 
 
 
149 aa  178  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  61.03 
 
 
154 aa  176  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  56.03 
 
 
148 aa  174  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
154 aa  171  3e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  63.08 
 
 
146 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  54.79 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  51.37 
 
 
146 aa  166  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  54.68 
 
 
139 aa  162  1e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  56.43 
 
 
150 aa  162  2e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  51.03 
 
 
148 aa  162  2e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  57.43 
 
 
148 aa  160  4e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
153 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  56.34 
 
 
144 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  52.17 
 
 
150 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  50.72 
 
 
148 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  52.41 
 
 
146 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  50.72 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  50.72 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  50.72 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  50.72 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  50.72 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  50.72 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  50.72 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  52.55 
 
 
139 aa  151  3e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  50.71 
 
 
147 aa  150  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  51.72 
 
 
144 aa  150  6e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  53.62 
 
 
145 aa  149  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  51.08 
 
 
145 aa  146  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  46.43 
 
 
148 aa  144  4e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  50.72 
 
 
151 aa  142  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
151 aa  138  2e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  51.03 
 
 
149 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  50 
 
 
181 aa  137  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  47.79 
 
 
148 aa  137  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  47.22 
 
 
148 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
144 aa  135  3e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  46.26 
 
 
160 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  44.37 
 
 
151 aa  133  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  46.53 
 
 
150 aa  132  1e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
145 aa  132  1e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
156 aa  129  1e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  42.66 
 
 
152 aa  129  1e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  46.67 
 
 
148 aa  129  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  46.38 
 
 
153 aa  129  1e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  48.92 
 
 
147 aa  128  2e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  42.34 
 
 
147 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  42.34 
 
 
147 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  41.96 
 
 
150 aa  127  4e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  39.58 
 
 
171 aa  127  4e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  46.38 
 
 
153 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  48.23 
 
 
151 aa  125  1e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  46.48 
 
 
149 aa  124  4e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  41.61 
 
 
155 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  45.21 
 
 
173 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
162 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
162 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4797  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
150 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.474617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  44.6 
 
 
151 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
145 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  40.14 
 
 
152 aa  119  1e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  44.6 
 
 
148 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  43.54 
 
 
146 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3679  response regulator receiver protein  46.77 
 
 
135 aa  117  8e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
141 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  42.96 
 
 
149 aa  116  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  43.88 
 
 
153 aa  116  1e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  37.41 
 
 
146 aa  115  1e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.74 
 
 
148 aa  115  2e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  43.07 
 
 
145 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  43.07 
 
 
151 aa  114  4e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  43.57 
 
 
150 aa  114  4e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.02211e-09  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  42.57 
 
 
160 aa  114  4e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
164 aa  113  7e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
141 aa  113  8e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  37.14 
 
 
148 aa  112  1e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
152 aa  112  1e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  39.19 
 
 
149 aa  112  1e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
155 aa  112  1e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
153 aa  111  4e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  43.17 
 
 
156 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
167 aa  110  7e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
153 aa  109  1e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5237  response regulator receiver protein  46.83 
 
 
136 aa  109  1e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
153 aa  109  1e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
153 aa  109  1e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
153 aa  109  2e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>