200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2293 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  233  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  56.07 
 
 
123 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  56.07 
 
 
123 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  53.85 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  59.43 
 
 
125 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  57.14 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  52.88 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  46.85 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  50.96 
 
 
152 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  59.34 
 
 
116 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  53.15 
 
 
177 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  49.11 
 
 
141 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  52.63 
 
 
118 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  50.88 
 
 
114 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  50.88 
 
 
114 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  47.42 
 
 
125 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  43.12 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  54.02 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  49.53 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  47.42 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  59.74 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  52.22 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  48.67 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  46.32 
 
 
115 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  56.32 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  42.16 
 
 
272 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  51.09 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  55.06 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  44.83 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  42.55 
 
 
263 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  49.38 
 
 
276 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  43.01 
 
 
263 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  43.01 
 
 
263 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  39.22 
 
 
270 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  41.3 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  35.78 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  51.95 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  51.95 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  41.58 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  44.19 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  40.43 
 
 
263 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  39.13 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  48.31 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  35.16 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  47.87 
 
 
265 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  43.59 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  43.33 
 
 
266 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  48.72 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  48.72 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  46.48 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  34.86 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  35.06 
 
 
245 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
268 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 
263 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  40.22 
 
 
263 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  42 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  49.23 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  48.81 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  30.61 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
258 aa  62.8  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  47.22 
 
 
259 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  30.38 
 
 
242 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  47.22 
 
 
259 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  53.25 
 
 
265 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  53.25 
 
 
265 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  47.22 
 
 
259 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  45.88 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
266 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  47.22 
 
 
259 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  45.68 
 
 
254 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  37.65 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.94 
 
 
263 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  32 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.94 
 
 
263 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  43.88 
 
 
252 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  46.05 
 
 
269 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  40.21 
 
 
259 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  40.21 
 
 
259 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  44.19 
 
 
254 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  40.21 
 
 
259 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  43.88 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  31.82 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  32.63 
 
 
245 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  45.45 
 
 
268 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.09 
 
 
298 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.78 
 
 
260 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  34.18 
 
 
233 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.09 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>