More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0561 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  100 
 
 
248 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  93.12 
 
 
248 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  80.82 
 
 
248 aa  329  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  74.03 
 
 
242 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  74.03 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  57.59 
 
 
242 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  57.53 
 
 
246 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.16 
 
 
245 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.21 
 
 
268 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.18 
 
 
223 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  37.66 
 
 
219 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.71 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.74 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.78 
 
 
257 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.8 
 
 
262 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.53 
 
 
1314 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1156  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
226 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0666674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  28.95 
 
 
214 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.2 
 
 
258 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.56 
 
 
1053 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.92 
 
 
243 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.82 
 
 
1051 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.42 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
216 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.74 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  33.94 
 
 
456 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.74 
 
 
1050 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.42 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.04 
 
 
215 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.02 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.82 
 
 
525 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.18 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  33.63 
 
 
456 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.73 
 
 
313 aa  95.9  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.59 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 
215 aa  95.5  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.12 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  34.78 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.47 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  32.3 
 
 
219 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  32.57 
 
 
456 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
396 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  37.44 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.67 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  28.37 
 
 
209 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.46 
 
 
1051 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.51 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34.67 
 
 
219 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  36.21 
 
 
986 aa  92.4  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  36.24 
 
 
218 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.58 
 
 
1053 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.96 
 
 
1055 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.22 
 
 
1052 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.65 
 
 
1053 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  35 
 
 
230 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.33 
 
 
1088 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.1 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.63 
 
 
1125 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.1 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.1 
 
 
263 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.9 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.93 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  29.9 
 
 
216 aa  85.5  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  33.59 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.19 
 
 
243 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  32.43 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  32.29 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.46 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.2 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  31.98 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.52 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  34.06 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  29.15 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  28.24 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.68 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  32.52 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  31.67 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  34.36 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  35.5 
 
 
219 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  35.5 
 
 
219 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  35.5 
 
 
219 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  40.32 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  26.22 
 
 
228 aa  82  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.14 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 
222 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.04 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.61 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  34.17 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  33.93 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.51 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  31.96 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  34.01 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  33.97 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.38 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>