More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0152 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
155 aa  313  7e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  93.55 
 
 
155 aa  300  4e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  70.78 
 
 
156 aa  236  7e-62  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  236  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.00899e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.19716e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.71364e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.01536e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.53509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.54226e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  70.13 
 
 
156 aa  234  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.84124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  68.83 
 
 
156 aa  232  2e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.07065e-08  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  68.83 
 
 
156 aa  231  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.22737e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  68.18 
 
 
156 aa  231  4e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.42376e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  68.83 
 
 
156 aa  229  7e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  1.47883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  68.83 
 
 
156 aa  229  7e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  8.92295e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  68.83 
 
 
156 aa  229  7e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  67.53 
 
 
156 aa  229  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  67.1 
 
 
155 aa  225  2e-58  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  225  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  223  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  4.72522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  66.23 
 
 
156 aa  223  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.31249e-15  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  66.23 
 
 
156 aa  222  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  221  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  5.71074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  219  1e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  218  2e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  65.16 
 
 
155 aa  218  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  216  8e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  3.043e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  215  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.39374e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  215  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  214  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  5.4268e-11  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  214  3e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.88797e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  214  3e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.10678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  214  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.41191e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  214  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.34832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  214  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.61589e-07  decreased coverage  2.14239e-06 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  213  1e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  212  1e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  211  2e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  211  3e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  211  3e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.1851e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  211  4e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  210  5e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  209  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
156 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  64.29 
 
 
156 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  58.44 
 
 
156 aa  206  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  205  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  204  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.92136e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  204  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  204  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
157 aa  202  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.12886e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  203  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  202  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  58.06 
 
 
155 aa  202  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  202  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  201  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  201  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  201  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.4788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  201  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  201  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  59.09 
 
 
157 aa  201  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  200  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  200  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  200  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  199  1e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  57.14 
 
 
156 aa  199  1e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  199  1e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  198  2e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  1.10546e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  198  2e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.49604e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  198  2e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  199  2e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0578  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  197  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  198  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0705  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  197  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.1534e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  198  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.12284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  197  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  197  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  197  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6053  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  197  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  196  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  3.12429e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  196  8e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  196  9e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  195  1e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  55.19 
 
 
156 aa  196  1e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  195  1e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  195  2e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 
155 aa  194  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  194  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  194  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  5.63067e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  194  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  194  4e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  194  5e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  52.6 
 
 
156 aa  194  5e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  54.55 
 
 
156 aa  193  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.69779e-09  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3924  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  193  8e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
156 aa  192  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>