82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3111 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  46.04 
 
 		 153 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  48.23 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  41.43 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  40.58 
 
 		 150 aa  123  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  45.14 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  46.1 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  39.44 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  38.3 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  41.26 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  40.15 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  41.84 
 
 		 149 aa  100  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  43.65 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  38.3 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  37.33 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  37.68 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  97.1  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  43.17 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  41.73 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  36.11 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  42.28 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  42.4 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  37.76 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  39.72 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  39.53 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  39.53 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  39.71 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  37.98 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  38.76 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  38.76 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  38.76 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  38.76 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  39.84 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  39.53 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  39.06 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  35.25 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  35 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  37.8 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  37.67 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  38.76 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  38.76 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  38.76 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  38.76 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  32.37 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  43.33 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  35.71 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  35.71 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  36.55 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  31.88 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  30.71 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  31.88 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  29.25 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  31.72 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  23.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  33.1 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  27.7 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  31.16 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  28.67 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  25.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  25.35 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  27.59 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  28.38 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  24.49 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  23.97 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  25.85 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  27.34 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  26.06 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  22.46 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2810  hypothetical protein  34.72 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547637  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  31.85 
 
 		 488 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  24.83 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  32.39 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>