51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0019 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  290  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  48.99 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  51.03 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  50.34 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  48.91 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  50.34 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  50.34 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  48.28 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  47.18 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  47.59 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  43.92 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  51.33 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  46.21 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  48.48 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  46.43 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  46.97 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  44.67 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  44.67 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  44.67 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  44.67 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  44.67 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  48.48 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  44 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  48.97 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  43.28 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  46.21 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  42.57 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  48.28 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  43.84 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  35.81 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  43.18 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  40 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  40 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  40 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  38.89 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  38.1 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  39.1 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  34.01 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  39.1 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  35.38 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  28.67 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>