49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_7054 on replicon NC_010374
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  100 
 
 		 739 aa  1485    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  44.17 
 
 		 399 aa  333  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  40.08 
 
 		 650 aa  324  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  37.68 
 
 		 521 aa  264  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  35.57 
 
 		 535 aa  260  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  58.26 
 
 		 841 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  36.78 
 
 		 701 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  32.42 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  36.67 
 
 		 685 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  28.12 
 
 		 866 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  48.33 
 
 		 272 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  27.11 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  31.61 
 
 		 643 aa  196  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 572 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  28.45 
 
 		 880 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  46.67 
 
 		 930 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  29.64 
 
 		 636 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  32.22 
 
 		 525 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  33.52 
 
 		 545 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  32.58 
 
 		 427 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  33.64 
 
 		 377 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  37.9 
 
 		 979 aa  144  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  39.64 
 
 		 845 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  41.76 
 
 		 759 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  42.6 
 
 		 712 aa  107  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  38.69 
 
 		 716 aa  107  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  29.25 
 
 		 847 aa  106  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  40.59 
 
 		 760 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  34.09 
 
 		 351 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  39.56 
 
 		 720 aa  104  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  41.18 
 
 		 765 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  40.83 
 
 		 712 aa  101  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  40.83 
 
 		 712 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  40.83 
 
 		 712 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  33.71 
 
 		 682 aa  95.5  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  34.43 
 
 		 731 aa  95.1  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  33.8 
 
 		 834 aa  93.6  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  92.8  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  32.54 
 
 		 892 aa  90.9  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  39.41 
 
 		 755 aa  84  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  26.01 
 
 		 838 aa  80.9  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  29.9 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  28.09 
 
 		 815 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1027 aa  55.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  29.65 
 
 		 895 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  34.15 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  37.61 
 
 		 278 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  33.62 
 
 		 718 aa  44.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  33.66 
 
 		 277 aa  43.9  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>