More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6098 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  100 
 
 
389 aa  748    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  80.98 
 
 
389 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  68.44 
 
 
389 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  60.99 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  61.7 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  58.18 
 
 
394 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  55.53 
 
 
390 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  53.75 
 
 
393 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  52.5 
 
 
401 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  52.26 
 
 
402 aa  363  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  49.49 
 
 
403 aa  363  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  52.26 
 
 
402 aa  361  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  53.38 
 
 
400 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  52.17 
 
 
398 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  53.51 
 
 
396 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  51.01 
 
 
396 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  51.79 
 
 
404 aa  359  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  51.13 
 
 
392 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  53.16 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  52.19 
 
 
398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  50.12 
 
 
411 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  53.35 
 
 
400 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  51.03 
 
 
393 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  48.73 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  49.49 
 
 
394 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  50.64 
 
 
405 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  50.65 
 
 
396 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  50.65 
 
 
396 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  50.39 
 
 
396 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  49.11 
 
 
392 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  51.49 
 
 
401 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  55.33 
 
 
1230 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  53.12 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  49.1 
 
 
397 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  50 
 
 
393 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  50 
 
 
393 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  50.61 
 
 
416 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  51.04 
 
 
390 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  48.48 
 
 
400 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  46.13 
 
 
404 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  51.39 
 
 
404 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  47.73 
 
 
393 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  49.1 
 
 
391 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  47.28 
 
 
408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  54.82 
 
 
1230 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  51.92 
 
 
402 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  48.24 
 
 
395 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  48.5 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  48.39 
 
 
403 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  48.51 
 
 
405 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  50.25 
 
 
1305 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  53.55 
 
 
1228 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  48.7 
 
 
412 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  47.76 
 
 
407 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  48.88 
 
 
399 aa  316  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  50.63 
 
 
399 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  47.21 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  48.57 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  50.65 
 
 
399 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  48.51 
 
 
410 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  47.19 
 
 
391 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  44.08 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  49.48 
 
 
394 aa  309  5e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  47.72 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  51.3 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  51.3 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  49.36 
 
 
392 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  49.11 
 
 
392 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  49.36 
 
 
392 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  42.6 
 
 
394 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  49.49 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  48.85 
 
 
392 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  49.11 
 
 
392 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  49.11 
 
 
392 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  49.11 
 
 
392 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  45.92 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  44.1 
 
 
401 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  41.37 
 
 
398 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  47.97 
 
 
412 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  49.37 
 
 
413 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  44.42 
 
 
396 aa  290  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  52.79 
 
 
397 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  45.32 
 
 
407 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  45.15 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  41.88 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  39.59 
 
 
408 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  42.42 
 
 
396 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  44.84 
 
 
394 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  44.65 
 
 
401 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  41.77 
 
 
397 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  36.59 
 
 
404 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  51.82 
 
 
385 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.35 
 
 
398 aa  275  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  40.39 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  44.84 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  41.73 
 
 
410 aa  273  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  37.44 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  39.9 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  38.4 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  39.64 
 
 
399 aa  272  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>