More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2248 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  100 
 
 
270 aa  517  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  87.78 
 
 
270 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  69.08 
 
 
272 aa  337  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  69.08 
 
 
272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  68.32 
 
 
272 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  66.92 
 
 
271 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  50.81 
 
 
273 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  48.03 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  47.53 
 
 
273 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.67 
 
 
271 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  45.77 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  45.67 
 
 
270 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  46.8 
 
 
271 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.49 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  44.88 
 
 
248 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  44.49 
 
 
275 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  43.97 
 
 
268 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  44.71 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  40.48 
 
 
269 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  41.34 
 
 
261 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  39.77 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  38.65 
 
 
269 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  40.71 
 
 
264 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  41.67 
 
 
272 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  38.46 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  38.22 
 
 
269 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  37.84 
 
 
265 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  38.46 
 
 
254 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  39.48 
 
 
264 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  34.01 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  39.92 
 
 
259 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  37.89 
 
 
263 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  34.7 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  38.55 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.36 
 
 
260 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  35.9 
 
 
258 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  37.21 
 
 
265 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  33.33 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.82 
 
 
269 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  35.71 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  35.71 
 
 
258 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  31.94 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  35.45 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  34.54 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.94 
 
 
270 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.56 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.56 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.39 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.94 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.92 
 
 
275 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.94 
 
 
270 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.56 
 
 
270 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.48 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.18 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.78 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0345  Inositol-phosphate phosphatase  35.39 
 
 
288 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.67 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.36 
 
 
276 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  33.19 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  33.19 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  33.19 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  33.19 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.76 
 
 
269 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.29 
 
 
269 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  36.77 
 
 
273 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.43 
 
 
267 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  32.34 
 
 
267 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  30.95 
 
 
272 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.64 
 
 
270 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  31.91 
 
 
267 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  32.77 
 
 
267 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  32.57 
 
 
266 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5401  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.46 
 
 
269 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0123  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.33 
 
 
257 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0394  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.55 
 
 
272 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  31.91 
 
 
267 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  31.91 
 
 
267 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  31.62 
 
 
255 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  31.49 
 
 
267 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  31.06 
 
 
267 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68370  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.36 
 
 
273 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00165193  normal  0.391986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5915  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35 
 
 
270 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31 
 
 
271 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.86 
 
 
271 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  33.8 
 
 
269 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4940  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  34.77 
 
 
280 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.4 
 
 
272 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  28.94 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  35.29 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.07 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  28.38 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2058  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.5 
 
 
274 aa  99  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  29.36 
 
 
267 aa  99  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  35.35 
 
 
281 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0425  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.55 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0173  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase-like  33.47 
 
 
289 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82997  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  30.64 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0717  inositol monophosphatase family protein  33.48 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0285  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  35.63 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1908  histidinol-phosphate phosphatase, putative  34.73 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>