More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2260 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  97 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  97 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  96.63 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  95.13 
 
 		 267 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  93.26 
 
 		 267 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  93.26 
 
 		 267 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  93.26 
 
 		 267 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  93.26 
 
 		 267 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  85.02 
 
 		 267 aa  487  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  89.51 
 
 		 267 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  87.27 
 
 		 267 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  81.65 
 
 		 283 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  81.65 
 
 		 267 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  79.03 
 
 		 267 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  80.52 
 
 		 266 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  65.41 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  64.04 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  64.42 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  64.04 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  64.04 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  63.67 
 
 		 267 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  63.3 
 
 		 267 aa  361  8e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  63.3 
 
 		 267 aa  361  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  62.55 
 
 		 267 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  62.17 
 
 		 267 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  62.17 
 
 		 267 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  62.17 
 
 		 267 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  61.42 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  61.05 
 
 		 267 aa  350  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  59.3 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  60.08 
 
 		 267 aa  333  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  58.91 
 
 		 267 aa  331  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  56.98 
 
 		 288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.31 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0714  inositol-1-monophosphatase  50.19 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  59.69 
 
 		 259 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  58.82 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  54.86 
 
 		 266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  54.44 
 
 		 266 aa  301  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.09 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  56.15 
 
 		 431 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  53.51 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  56.15 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  53.51 
 
 		 271 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  53.14 
 
 		 271 aa  294  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  52.77 
 
 		 271 aa  294  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.23 
 
 		 265 aa  294  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  53.14 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  52.21 
 
 		 272 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  52.21 
 
 		 272 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  52.57 
 
 		 272 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  52.57 
 
 		 272 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  51.84 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.68 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.46 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.12 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  56.03 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  55.25 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  52.24 
 
 		 268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  51.18 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  53.31 
 
 		 262 aa  281  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  52.92 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  51.36 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  52.63 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  54.51 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  51.69 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  49.81 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  49.81 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 		 270 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.82 
 
 		 274 aa  274  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  54.47 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  53.44 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  50.19 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  51.33 
 
 		 270 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  53.7 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  52.85 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  54.09 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  54.09 
 
 		 320 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  54.09 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  54.09 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  54.09 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  54.09 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  54.09 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  52.33 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  52.06 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  47.57 
 
 		 266 aa  264  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>