More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0902 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  100 
 
 
270 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  59.22 
 
 
269 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  57.03 
 
 
269 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  60.58 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  49.8 
 
 
264 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  44.36 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  43.46 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  48.02 
 
 
268 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  43.08 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  45.02 
 
 
273 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  41.63 
 
 
271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.4 
 
 
271 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  42.21 
 
 
272 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  47.03 
 
 
253 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  46.96 
 
 
248 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  42.21 
 
 
272 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
272 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  44.32 
 
 
271 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  41.51 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  47.23 
 
 
278 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  44.26 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  42.91 
 
 
273 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  43.6 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  44 
 
 
261 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  39.85 
 
 
260 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  43.2 
 
 
258 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  39.77 
 
 
270 aa  175  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  41.73 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  38.1 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  39.02 
 
 
270 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
258 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  39.16 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  43.75 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  36.74 
 
 
274 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  37.9 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  39.11 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  38.93 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  35.86 
 
 
265 aa  118  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  31.73 
 
 
281 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  28.96 
 
 
293 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3674  inositol monophosphatase  30.77 
 
 
292 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3728  inositol monophosphatase  30.77 
 
 
292 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.275945  normal  0.190022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  32.91 
 
 
270 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  31.88 
 
 
402 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  25.86 
 
 
271 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.2 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0123  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.07 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0280  histidinol-phosphate phosphatase  31.91 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0307412  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1341  inositol monophosphatase  30.71 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.435711  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  31.4 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5915  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.08 
 
 
270 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68370  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.08 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00165193  normal  0.391986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4200  inositol monophosphatase  32.68 
 
 
277 aa  95.5  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0701939  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  28.15 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1220  histidinol-phosphate phosphatase  30.97 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427245  normal  0.220917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.42 
 
 
267 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  32 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1174  inositol-phosphate phosphatase  26.18 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.25 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0179  3(2),5-bisphosphate nucleotidase  27.69 
 
 
260 aa  92.8  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00838731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
276 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  27.92 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2557  inositol-phosphate phosphatase  35.57 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462012  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  29.48 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  29.55 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  29.37 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  29.37 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4536  inositol-phosphate phosphatase  31.9 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0945  histidinol-phosphate phosphatase, putative  31.27 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0589084  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  29.21 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.56 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3711  Inositol-phosphate phosphatase  31.2 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0935134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.87 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  30.34 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1850  CysQ  26.97 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.4 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.76 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  30.34 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.31 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3118  inositol-phosphate phosphatase  33.19 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  29.37 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  31.73 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  29.41 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3055  inositol-phosphate phosphatase  29.23 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00295141  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  28.75 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  31.01 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  28.79 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2058  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.77 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  32.42 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1378  inositol monophosphatase  27.34 
 
 
256 aa  89  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032162  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  28.79 
 
 
267 aa  89  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  28.89 
 
 
272 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3700  histidinol-phosphate phosphatase, putative  31.73 
 
 
258 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000574664  normal  0.0324911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  28.79 
 
 
263 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  29.55 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1427  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.34 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  26.09 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  28.89 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1308  inositol monophosphatase  27.34 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.730975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>