More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1289 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  100 
 
 
267 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  85.02 
 
 
267 aa  487  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  85.02 
 
 
267 aa  487  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  84.64 
 
 
267 aa  487  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  84.64 
 
 
267 aa  487  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  84.27 
 
 
267 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  83.52 
 
 
267 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  83.52 
 
 
267 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  83.52 
 
 
267 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  83.52 
 
 
267 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  80.15 
 
 
267 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  82.77 
 
 
267 aa  460  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  77.9 
 
 
267 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  77.53 
 
 
283 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  81.65 
 
 
267 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  79.4 
 
 
266 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  65.04 
 
 
268 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  64.42 
 
 
267 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  64.04 
 
 
267 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  64.42 
 
 
267 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  64.42 
 
 
267 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  63.67 
 
 
267 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  64.42 
 
 
267 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  63.67 
 
 
267 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  64.04 
 
 
267 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  63.3 
 
 
267 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  62.17 
 
 
267 aa  367  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  61.8 
 
 
267 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  62.17 
 
 
267 aa  363  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  61.8 
 
 
267 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  61.8 
 
 
267 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  61.8 
 
 
267 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  60.3 
 
 
267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  59.69 
 
 
262 aa  351  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  59.25 
 
 
267 aa  349  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  56.98 
 
 
288 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  56.98 
 
 
267 aa  341  7e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  60.78 
 
 
255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.81 
 
 
268 aa  324  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0714  inositol-1-monophosphatase  51.31 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  58.53 
 
 
259 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  55.35 
 
 
271 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  53.87 
 
 
271 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  54.61 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  53.14 
 
 
271 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  52.51 
 
 
266 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  52.77 
 
 
271 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  52.53 
 
 
266 aa  299  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  52.94 
 
 
272 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  52.94 
 
 
272 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  52.14 
 
 
263 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  51.84 
 
 
272 aa  295  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  52.21 
 
 
272 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  52.21 
 
 
272 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  54.23 
 
 
269 aa  295  7e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  55.38 
 
 
431 aa  294  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  52.24 
 
 
268 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.57 
 
 
265 aa  291  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  50.97 
 
 
272 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  50.79 
 
 
259 aa  287  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  49.81 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  50.56 
 
 
266 aa  285  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.08 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  51.13 
 
 
270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.94 
 
 
273 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  52.53 
 
 
259 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  50 
 
 
267 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  50 
 
 
267 aa  277  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  53.31 
 
 
267 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  51.75 
 
 
284 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  51.75 
 
 
262 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  52.53 
 
 
267 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  46.95 
 
 
261 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  46.95 
 
 
261 aa  275  8e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  49.06 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  50.57 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0005  inositol-1-monophosphatase  46.77 
 
 
268 aa  271  7e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  50.57 
 
 
270 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  50.38 
 
 
268 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  52.67 
 
 
266 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.39 
 
 
300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  52.67 
 
 
267 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.55 
 
 
328 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  50.56 
 
 
268 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  51.15 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  51.94 
 
 
330 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  49.43 
 
 
270 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  54.12 
 
 
304 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  50.58 
 
 
363 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  50.97 
 
 
320 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  50.57 
 
 
273 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  50.97 
 
 
267 aa  261  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  50.97 
 
 
267 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>