101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1515 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  100 
 
 
178 aa  362  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  72.73 
 
 
463 aa  268  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  71.02 
 
 
221 aa  263  9e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
329 aa  245  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
327 aa  244  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
316 aa  244  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
316 aa  244  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
316 aa  244  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
316 aa  244  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
316 aa  244  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
316 aa  244  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  70.91 
 
 
316 aa  244  7e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  70.3 
 
 
329 aa  243  1e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  70.3 
 
 
316 aa  242  2e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  67.61 
 
 
348 aa  241  4e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  67.61 
 
 
330 aa  241  4e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  67.61 
 
 
330 aa  241  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  67.61 
 
 
355 aa  241  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  67.61 
 
 
330 aa  241  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  67.61 
 
 
330 aa  240  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  67.05 
 
 
330 aa  239  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  68.48 
 
 
321 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  66.06 
 
 
320 aa  233  8e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  71.61 
 
 
188 aa  232  2e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  68.9 
 
 
303 aa  231  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  66.67 
 
 
206 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 
319 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 
319 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  66.67 
 
 
319 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  66.67 
 
 
319 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  80.95 
 
 
277 aa  212  2e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  58.19 
 
 
284 aa  204  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  58.76 
 
 
314 aa  204  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  57.06 
 
 
314 aa  202  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  57.06 
 
 
320 aa  202  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  194  4e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  194  4e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  194  4e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  194  4e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  194  5e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  194  5e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  58.79 
 
 
321 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  57.93 
 
 
265 aa  185  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  75.86 
 
 
286 aa  184  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  75.86 
 
 
329 aa  184  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  78.38 
 
 
111 aa  181  4e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  63.39 
 
 
259 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  41.32 
 
 
343 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  41.32 
 
 
332 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  38.86 
 
 
329 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  39.16 
 
 
274 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  36.69 
 
 
321 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 
321 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 
333 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 
463 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  40.48 
 
 
323 aa  91.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  37.57 
 
 
323 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  39.88 
 
 
179 aa  89  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  37.57 
 
 
323 aa  88.6  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  37.91 
 
 
323 aa  85.9  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  38.6 
 
 
216 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  38.6 
 
 
216 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  40.62 
 
 
289 aa  83.6  1e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  39.1 
 
 
289 aa  81.3  6e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  40.16 
 
 
289 aa  81.3  7e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  40 
 
 
302 aa  80.9  8e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  40.16 
 
 
289 aa  80.9  8e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  34.73 
 
 
323 aa  81.3  8e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  38.37 
 
 
325 aa  80.5  1e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  38.37 
 
 
325 aa  80.5  1e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  39.84 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  39.84 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  40.17 
 
 
288 aa  79.7  2e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  39.84 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  39.84 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  42.61 
 
 
272 aa  77.8  8e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  39.02 
 
 
288 aa  77.8  8e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  31.76 
 
 
327 aa  77  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  31.76 
 
 
325 aa  77  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  31.76 
 
 
441 aa  77  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  31.76 
 
 
325 aa  77  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  31.76 
 
 
325 aa  77  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  31.76 
 
 
329 aa  77  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  31.76 
 
 
333 aa  77  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  31.76 
 
 
325 aa  76.6  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  54.76 
 
 
185 aa  76.3  2e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4700  integrase, catalytic region  66.1 
 
 
65 aa  76.3  2e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  36.92 
 
 
288 aa  76.3  2e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  31.93 
 
 
497 aa  76.6  2e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  34.51 
 
 
157 aa  75.1  5e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  39.66 
 
 
284 aa  74.7  6e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0143  hypothetical protein  83.33 
 
 
42 aa  71.6  5e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  35.43 
 
 
336 aa  70.9  8e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  34.38 
 
 
293 aa  70.1  1e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  32.94 
 
 
330 aa  65.9  3e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1683  hypothetical protein  40.35 
 
 
275 aa  58.2  7e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  36.13 
 
 
290 aa  57.4  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0371  hypothetical protein  56.25 
 
 
83 aa  54.7  8e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2980  hypothetical protein  32.71 
 
 
274 aa  52.8  3e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653613  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1518  hypothetical protein  32 
 
 
101 aa  51.2  8e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>