More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0685 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  54.79 
 
 		 292 aa  328  9e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  57.79 
 
 		 291 aa  328  9e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  58.82 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  58.82 
 
 		 295 aa  315  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 295 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  58.48 
 
 		 295 aa  314  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  57.79 
 
 		 295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  57.79 
 
 		 295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  58.13 
 
 		 295 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  56.4 
 
 		 294 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  55.48 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  55.48 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  55.71 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  47.01 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  46.18 
 
 		 341 aa  251  9.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  44.41 
 
 		 346 aa  241  7e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  44.25 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  45.18 
 
 		 346 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  44.79 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 311 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.02 
 
 		 289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.69 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  43.1 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  43 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  44.3 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  43.09 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 297 aa  221  7e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.79 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  44.79 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  42.21 
 
 		 290 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  44.91 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 285 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  42.36 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  41.44 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  45.07 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  44.06 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  41.64 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  41.13 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  41.13 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  41.13 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  41.92 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.28 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  41.36 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  42.05 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  43.4 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  43.4 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  42.36 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  42.36 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.84 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  42.36 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  40.43 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  43.4 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.18 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  42.71 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  42.18 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  41.49 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  42.66 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  40.21 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  42.03 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>