More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0528 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
338 aa  687    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.48 
 
 
351 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.46 
 
 
338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.25 
 
 
339 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.53 
 
 
336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.53 
 
 
333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.22 
 
 
333 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.22 
 
 
336 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.22 
 
 
336 aa  442  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.22 
 
 
333 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.22 
 
 
333 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.35 
 
 
541 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.53 
 
 
333 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.84 
 
 
333 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.84 
 
 
333 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 
333 aa  435  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.02 
 
 
332 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.23 
 
 
333 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.47 
 
 
318 aa  426  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 
336 aa  418  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.94 
 
 
335 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.89 
 
 
333 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.44 
 
 
342 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.37 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.76 
 
 
338 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 
338 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.82 
 
 
338 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
336 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 
330 aa  408  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.59 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.27 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.38 
 
 
345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.49 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.37 
 
 
334 aa  401  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 
334 aa  401  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.32 
 
 
336 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  58.01 
 
 
341 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 
334 aa  401  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.44 
 
 
338 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.15 
 
 
346 aa  401  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.81 
 
 
338 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.06 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 
341 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.75 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.83 
 
 
346 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.44 
 
 
352 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.76 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
345 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.38 
 
 
348 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.01 
 
 
341 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 
334 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.59 
 
 
337 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.62 
 
 
335 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 
354 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.62 
 
 
345 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 
355 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 
371 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 
334 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.2 
 
 
338 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 
334 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
357 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 
348 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
356 aa  391  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 
357 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.78 
 
 
346 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 
360 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 
348 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 
334 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.57 
 
 
352 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.12 
 
 
353 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 
348 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  58.51 
 
 
349 aa  391  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 
336 aa  391  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.95 
 
 
347 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.62 
 
 
332 aa  391  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 
344 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 
348 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 
350 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 
356 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.32 
 
 
360 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
348 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.63 
 
 
354 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 
363 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
356 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
357 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 
337 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 
336 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 
354 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 
336 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 
349 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 
356 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.53 
 
 
358 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 
355 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.06 
 
 
355 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 
336 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>