131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0026 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  665  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  55.86 
 
 
331 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  51.82 
 
 
347 aa  355  4e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  43.83 
 
 
333 aa  270  3e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  43.54 
 
 
334 aa  265  9e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.59 
 
 
359 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  41.3 
 
 
334 aa  246  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  37.12 
 
 
329 aa  221  1e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  39.31 
 
 
337 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  37.88 
 
 
329 aa  216  6e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  39.72 
 
 
322 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.39 
 
 
325 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  36.11 
 
 
341 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  37.37 
 
 
317 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.43 
 
 
321 aa  201  1e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.72 
 
 
321 aa  197  2e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.93 
 
 
319 aa  192  9e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  34.16 
 
 
317 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  33.45 
 
 
317 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  33.22 
 
 
317 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  36.24 
 
 
320 aa  188  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  36.36 
 
 
329 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  36.73 
 
 
319 aa  184  1e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.03 
 
 
323 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  35 
 
 
322 aa  183  4e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  36.68 
 
 
321 aa  182  5e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  36.68 
 
 
321 aa  182  5e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  36.68 
 
 
321 aa  182  5e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  36.68 
 
 
321 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.03 
 
 
323 aa  182  9e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.03 
 
 
323 aa  182  9e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.03 
 
 
323 aa  182  9e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.03 
 
 
323 aa  182  9e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  36.03 
 
 
323 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.95 
 
 
584 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  36.33 
 
 
321 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  34.16 
 
 
321 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.03 
 
 
323 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.69 
 
 
323 aa  179  6e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  31.94 
 
 
321 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  33.22 
 
 
316 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  32.29 
 
 
322 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  35.17 
 
 
329 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  34.25 
 
 
323 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  35.17 
 
 
326 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  34.83 
 
 
326 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  37.99 
 
 
270 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  33.22 
 
 
324 aa  174  2e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  33.45 
 
 
325 aa  174  3e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  33.45 
 
 
325 aa  173  3e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.8 
 
 
327 aa  172  6e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  33.45 
 
 
323 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  28.96 
 
 
338 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  33.1 
 
 
322 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  36.77 
 
 
331 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  31.72 
 
 
343 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  32.41 
 
 
322 aa  164  1e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  27.95 
 
 
324 aa  164  2e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  35.57 
 
 
320 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  34.26 
 
 
328 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  31.25 
 
 
344 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  33.45 
 
 
323 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  31.33 
 
 
337 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  33.97 
 
 
332 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.67 
 
 
336 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  33.55 
 
 
332 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  31.51 
 
 
335 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  30.25 
 
 
341 aa  153  3e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  30.25 
 
 
341 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  29.31 
 
 
323 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  28.04 
 
 
324 aa  149  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  31.88 
 
 
320 aa  149  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  29.76 
 
 
349 aa  145  7e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  30.82 
 
 
330 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  29.34 
 
 
349 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  30.61 
 
 
331 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  31.54 
 
 
298 aa  139  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  29.41 
 
 
329 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  28.17 
 
 
370 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  28.47 
 
 
640 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  27.15 
 
 
327 aa  130  4e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  28.23 
 
 
340 aa  130  4e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  30.72 
 
 
313 aa  129  9e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.94 
 
 
352 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  24.68 
 
 
322 aa  113  4e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  26.6 
 
 
355 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  28.14 
 
 
324 aa  112  1e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  27.4 
 
 
354 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  25.98 
 
 
322 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.74 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  29.43 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  25.5 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  24.47 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.62 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  25.54 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  23.86 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  24.91 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  29.1 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  26.52 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  23.31 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>