More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0683 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  100 
 
 		 472 aa  926    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  100 
 
 		 472 aa  926    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.62 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  25.97 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.11 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  26.79 
 
 		 434 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  26.7 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  26.28 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  27.96 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  27.22 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  26.57 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  26.08 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  25.06 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  28.44 
 
 		 412 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  26.62 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  25.73 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  26.07 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  27.11 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  27.11 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  39.75 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  35.03 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.34 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  28.41 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  28.87 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  28.87 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  28.87 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  42.74 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  24.27 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  25.42 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  32.43 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  44.07 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.77 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  24.86 
 
 		 374 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  34.25 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  41.94 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  32.88 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  25.29 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.15 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  42.28 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  36.43 
 
 		 405 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  37.4 
 
 		 377 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  37.4 
 
 		 377 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  41.13 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  41.13 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  37.4 
 
 		 344 aa  97.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  26.32 
 
 		 417 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  41.13 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  41.13 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  41.13 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  41.13 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  41.13 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  41.13 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  41.13 
 
 		 427 aa  97.1  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  30.82 
 
 		 377 aa  97.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  40.54 
 
 		 372 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  26.96 
 
 		 377 aa  96.7  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  33.1 
 
 		 378 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  40.54 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  31.09 
 
 		 362 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  40.54 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  28.25 
 
 		 361 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  34.03 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  31.09 
 
 		 362 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  30.03 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  34.59 
 
 		 362 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  34.59 
 
 		 362 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  35.25 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.06 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  22.71 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  21.38 
 
 		 397 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.91 
 
 		 370 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  36.84 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  38.46 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  36.8 
 
 		 387 aa  90.1  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.06 
 
 		 375 aa  90.1  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  25.33 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  28.34 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  38.24 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  33.33 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  30 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  33.58 
 
 		 375 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  35.77 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  38.14 
 
 		 240 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  38.14 
 
 		 363 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  26.37 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  24.92 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.53 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  28.66 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  24.23 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.83 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  28.24 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  34.88 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.23 
 
 		 413 aa  83.2  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  26.09 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  20.92 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  34.88 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  24.61 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  28.36 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  31.21 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>