219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2065 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  62.22 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  63.04 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  63.7 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  60.42 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  54.89 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  53.85 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  55.2 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  48.48 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  54.4 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  54.4 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  54.47 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  52.34 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  52.67 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  51.54 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  51.54 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  51.54 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  51.54 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  51.54 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  51.54 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  51.54 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  54.17 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  54.63 
 
 		 213 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  36.15 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  36.15 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  37.98 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  36.72 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  32.03 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  30.77 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  34.65 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  33.33 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.28 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  31.78 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  39.51 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  39.51 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  39.51 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  28.97 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  28.36 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.78 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  33.07 
 
 		 203 aa  57  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  28.78 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  32.82 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>