More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1174 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  85.75 
 
 		 428 aa  747    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  712    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  82.2 
 
 		 427 aa  721    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  81.5 
 
 		 427 aa  713    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  80.8 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  77.99 
 
 		 427 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  81.12 
 
 		 429 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  78.01 
 
 		 427 aa  688    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  78.45 
 
 		 428 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  73.77 
 
 		 427 aa  672    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  76.58 
 
 		 427 aa  661    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  89.93 
 
 		 427 aa  797    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  76.58 
 
 		 427 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  89.7 
 
 		 427 aa  772    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  80.8 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  90.42 
 
 		 428 aa  772    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  82.44 
 
 		 427 aa  723    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  81.35 
 
 		 429 aa  713    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  91.82 
 
 		 428 aa  802    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 427 aa  867    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  81.5 
 
 		 427 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  88.91 
 
 		 433 aa  784    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  90.65 
 
 		 428 aa  775    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  91.36 
 
 		 428 aa  799    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  81.5 
 
 		 427 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  78.69 
 
 		 428 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  89.46 
 
 		 427 aa  785    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  80.56 
 
 		 427 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  91.36 
 
 		 428 aa  795    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  69.46 
 
 		 430 aa  624  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  68.14 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  68.14 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  68.14 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  68.14 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  69.05 
 
 		 430 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  69.09 
 
 		 426 aa  610  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 		 430 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 429 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  68.53 
 
 		 429 aa  601  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  70.42 
 
 		 426 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  68.14 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 431 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 431 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  68.54 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 428 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  65.27 
 
 		 431 aa  584  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  67.99 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  64.79 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 		 434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 		 434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  65.95 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  66.04 
 
 		 425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.88 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.58 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 426 aa  571  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>