219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1020 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 374 aa  771    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  54.96 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  52.52 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  53.33 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  50.79 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  48.68 
 
 		 384 aa  362  4e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  47.86 
 
 		 379 aa  362  4e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  47.59 
 
 		 379 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  50.26 
 
 		 384 aa  360  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  46.79 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  46.79 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  46.79 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  46.79 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  46.79 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  46.79 
 
 		 379 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  46.52 
 
 		 379 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  46.52 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  46.26 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  45.99 
 
 		 384 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  45.7 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  46.79 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  45.7 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  44.5 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  44.39 
 
 		 380 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  43.43 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  45.53 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  44.47 
 
 		 375 aa  311  9e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  44.47 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  43.85 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  42.4 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  42.18 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  41.6 
 
 		 382 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  44.89 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  41.53 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  42.02 
 
 		 400 aa  296  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  43.13 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  40.85 
 
 		 380 aa  268  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  38.75 
 
 		 375 aa  255  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  38.01 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  36.22 
 
 		 375 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  36.22 
 
 		 375 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  36.46 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  35.92 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  35.66 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  35.73 
 
 		 403 aa  225  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  35.15 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  34.58 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  33.51 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  32.43 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  31.64 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  33.24 
 
 		 484 aa  186  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  35.14 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.53 
 
 		 709 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  31.25 
 
 		 393 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  35.09 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.86 
 
 		 738 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.26 
 
 		 709 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.99 
 
 		 709 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  31.73 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.99 
 
 		 709 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.46 
 
 		 706 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.46 
 
 		 706 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.46 
 
 		 706 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  30.16 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.83 
 
 		 713 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  32.52 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.46 
 
 		 706 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.91 
 
 		 709 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.21 
 
 		 708 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.29 
 
 		 705 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  33.88 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.91 
 
 		 711 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  30.52 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.91 
 
 		 713 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.91 
 
 		 713 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.51 
 
 		 705 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.75 
 
 		 712 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.95 
 
 		 711 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.64 
 
 		 711 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.65 
 
 		 713 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  30.29 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  31.34 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.95 
 
 		 701 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  32.89 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  29.08 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  32.53 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.22 
 
 		 708 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  32.15 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.45 
 
 		 711 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.06 
 
 		 749 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.93 
 
 		 730 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.93 
 
 		 730 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.34 
 
 		 707 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.54 
 
 		 707 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.5 
 
 		 725 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  31.52 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  34.22 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.02 
 
 		 730 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  30.65 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.08 
 
 		 707 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>