219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1963 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  57.76 
 
 		 169 aa  190  6e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  55.35 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  52.2 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  48.73 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  49.69 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  47.8 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  36.81 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  37.18 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 		 161 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  34.38 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  33.76 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  37.82 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  36.49 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  30.57 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  32.9 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  34.59 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  38.05 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  29.68 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  30.92 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  29.68 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  30.92 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  30.26 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  34 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  30.26 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  29.61 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  34.71 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.1 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  33.33 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  30.26 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  40.71 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  34.44 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  36.84 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  31.03 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  37.61 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  29.68 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  35.88 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  35.88 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  28.35 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  31.08 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  31.08 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  34.43 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  34.51 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  35.11 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  31.85 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.3 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  28.1 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  35.04 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  36.67 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  36.67 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  36.21 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  28.39 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  29.45 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  28.97 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  32.76 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  41.76 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  31.45 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  33.63 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  34.82 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  38.53 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  33.88 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3526  ybaK/ebsC protein  36.72 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  29.32 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  35.25 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0861  ybaK/ebsC protein  39.52 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.935106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  31.97 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  33.86 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  33 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  33.02 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  33.61 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  30.16 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  33.62 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.61 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  32.17 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  28.48 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>